Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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