Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms