Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rtl8cQ9D6I0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rtl8cQ9D6I0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rtl8cQ9D6I0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rtl8cQ9D6I0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rtl8cQ9D6I0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rtl8cQ9D6I0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rtl8cQ9D6I0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rtl8cQ9D6I0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rtl8cQ9D6I0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rtl8cQ9D6I0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rtl8cQ9D6I0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rtl8cQ9D6I0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rtl8cQ9D6I0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rtl8cQ9D6I0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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