Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms