Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpn3Q9D3W4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpn3Q9D3W4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpn3Q9D3W4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpn3Q9D3W4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpn3Q9D3W4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpn3Q9D3W4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms