Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt20Q9D312 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Krt20Q9D312 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms