Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trim42Q9D2H5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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