Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan11Q9D1D1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Tspan11Q9D1D1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan11Q9D1D1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan11Q9D1D1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan11Q9D1D1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan11Q9D1D1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Tspan11Q9D1D1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan11Q9D1D1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan11Q9D1D1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan11Q9D1D1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan11Q9D1D1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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