Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ndc80Q9D0F1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ndc80Q9D0F1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ndc80Q9D0F1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ndc80Q9D0F1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ndc80Q9D0F1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ndc80Q9D0F1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ndc80Q9D0F1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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