Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mms19Q9D071 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mms19Q9D071 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mms19Q9D071 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mms19Q9D071 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mms19Q9D071 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mms19Q9D071 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mms19Q9D071 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms