Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms