Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms