Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ddx28Q9CWT6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ddx28Q9CWT6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ddx28Q9CWT6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ddx28Q9CWT6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ddx28Q9CWT6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ddx28Q9CWT6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ddx28Q9CWT6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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