Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms