Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms