Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snw1Q9CSN1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms