Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PompQ9CQT5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PompQ9CQT5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PompQ9CQT5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PompQ9CQT5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PompQ9CQT5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PompQ9CQT5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PompQ9CQT5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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