Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Nicn1Q9CQM0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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