Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms