Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms