Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bhlhe41Q99PV5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms