Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel1Q99MW3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms