Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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Tdrd1Q99MV1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms