Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CalcbQ99MP3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CalcbQ99MP3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms