Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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PccbQ99MN9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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PccbQ99MN9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PccbQ99MN9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PccbQ99MN9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PccbQ99MN9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PccbQ99MN9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PccbQ99MN9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PccbQ99MN9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PccbQ99MN9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PccbQ99MN9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PccbQ99MN9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PccbQ99MN9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PccbQ99MN9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PccbQ99MN9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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