Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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