Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms