Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms