Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms