Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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