Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Smim11aQ99J19 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Smim11aQ99J19 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Smim11aQ99J19 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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