Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ctu1Q99J10 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ctu1Q99J10 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ctu1Q99J10 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ctu1Q99J10 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ctu1Q99J10 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ctu1Q99J10 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ctu1Q99J10 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ctu1Q99J10 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ctu1Q99J10 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ctu1Q99J10 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Ctu1Q99J10 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Ctu1Q99J10 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Ctu1Q99J10 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ctu1Q99J10 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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