Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tom1l1Q923U0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms