Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms