Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usb1Q91W78 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usb1Q91W78 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usb1Q91W78 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usb1Q91W78 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usb1Q91W78 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usb1Q91W78 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usb1Q91W78 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usb1Q91W78 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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