Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Tdrd3Q91W18 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Tdrd3Q91W18 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms