Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps4aQ8VEJ9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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