Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps37bQ8R0J7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms