Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cnot6Q8K3P5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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