Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms