Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms