Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ep400Q8CHI8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ep400Q8CHI8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ep400Q8CHI8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ep400Q8CHI8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ep400Q8CHI8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ep400Q8CHI8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ep400Q8CHI8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ep400Q8CHI8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ep400Q8CHI8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ep400Q8CHI8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ep400Q8CHI8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ep400Q8CHI8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms