Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd1bQ8CFT2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms