Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl11Q8CE33 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms