Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms