Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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