Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Q8BP99 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Q8BP99 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BP99 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BP99 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BP99 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BP99 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BP99 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BP99 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BP99 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BP99 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BP99 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BP99 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BP99 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BP99 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Q8BP99 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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