Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNL5

Kctd6, BTB/POZ domain-containing protein KCTD6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd6Q8BNL5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd6Q8BNL5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd6Q8BNL5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd6Q8BNL5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd6Q8BNL5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd6Q8BNL5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd6Q8BNL5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd6Q8BNL5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd6Q8BNL5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd6Q8BNL5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd6Q8BNL5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd6Q8BNL5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd6Q8BNL5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd6Q8BNL5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kctd6Q8BNL5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.9 ms