Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms