Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tubgcp5Q8BKN5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tubgcp5Q8BKN5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tubgcp5Q8BKN5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tubgcp5Q8BKN5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubgcp5Q8BKN5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubgcp5Q8BKN5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubgcp5Q8BKN5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubgcp5Q8BKN5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubgcp5Q8BKN5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubgcp5Q8BKN5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubgcp5Q8BKN5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubgcp5Q8BKN5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubgcp5Q8BKN5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubgcp5Q8BKN5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tubgcp5Q8BKN5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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